Problème résolu !
Donc, j'ai formaté ma SD en FAT, recopié tous les nouveaux fichiers et réessayé : le bootmii menu était présent. Du coup, j'ai à nouveau éteint, branché le DD externe -> de nouveau plus de menu. Rebelotte, je réessaye en recopiant d'abord les fichiers : NOK. Test en passant à nouveau en formatant : NOK.
Je savais plus pourquoi j'avais qu'une seule fois ce menu.
Du coup, nouvelle idée : je prends une nouvelle SD, je recopie et... BINGO ! Je teste en branchant le DD : OK. Plusieurs essais de démarrage : OK !
Donc tout était lié à la SD. Pourtant la 1ere était 1Go Sandisk Ultra 2. Celle qui marche est une Emtec de 2Go 60x.
Et je me rappelle que mon 1er hack n'etait à l'époque pas possible à cause de la SD aussi (une 16Mb Canon), qui ne marchait pas pour hacker, mais en utilisation, oui.
Donc voilà

I'm happy !